H ανάπτυξη υπολογιστικών μοντέλων πολλαπλών κλιμάκων με στόχο την μελέτη της εξέλιξης καρκινικών κυττάρων, βοηθά στην περαιτέρω κατανόηση του τρόπου με τον οποίο αυτά τα κύτταρα κινούνται, αναπτύσσονται, διαιρούνται, αλληλεπιδρούν και πεθαίνουν. Τα μοντέλα πολλαπλών κλιμάκων λαμβάνουν υπόψιν το βιοχημικό περιβάλλον μέσα στο οποίο αναπτύσσονται τα καρκινικά κύτταρα αλλά και την αλληλεπίδρασή τους με αυτό με τους διάφορους κυτταρικούς μηχανισμούς.
Η πλατφόρμα προσομοίωσης ανοιχτού κώδικα PhysiCell, αποτελεί ένα λογισμικό προσομοίωσης σε παράγοντες (agent-based) για την προσομοίωση πολύπλοκων πολυκυτταρικών συστημάτων. Το PhysiCell δίνει την δυνατότητα προσομοίωσης του βιοχημικού μικροπεριβάλλοντος των ιστών καθώς και της αλληλεπίδρασης μεταξύ των κυττάρων. Μπορεί να προσαρμοστεί σε μια ευρεία ποικιλία προβλημάτων τα οποία περιλαμβάνουν την ανάπτυξη των καρκινικών κυττάρων, την εξέλιξη μολυσματικών ασθενειών και πολλά άλλα.
Στόχος του εργαστηρίου είναι:
• Η εξοικείωση με τον τρόπο λειτουργείας και χρήσης της πλατφόρμας PhysiCell σε περιβάλλον Linux.
• Η κατασκευή μοντέλων προσομοίωσης για την μελέτη των καρκινικών κυττάρων μέσω του PhysiCell.